由于父母离异，刚满10岁的忠志（神木隆之介饰）只好跟母亲来到乡下跟外公一起生活。一次偶然，忠志参拜神社时被选为“麒麟送子”。当地有个传说，被选为麒麟送子的孩子可在大天狗山顶，拿到传说中大天狗守护的飞剑。传说那飞剑是用来维护和平的，伙伴们揶揄他不敢上大天狗山取麒麟送子的宝剑。他在尝试一半后，被吓回来。另一方面，千年魔人加藤保宪（丰川悦司饰）复活，他利用废旧物品的怨气，将其与抓来的妖怪们扔到大怨灵炼火中融合形成邪恶的怪物军团，并率领它们企图毁灭人类。在山神、河童和川姬等妖怪的努力下，忠志通过了考验。为了保卫世界，忠志决定和妖怪们齐心合力，和大恶人决一死战，妖怪大战争正式展开！

三年前，议员岸和田连同高达51亿日元的巨款一起消失无踪，岸和田的情人兼同谋者腰越奈绪美（室井滋 饰）匆匆赶来，仅在房间内发现了一个全身是血失去意识的青年，三年后，奈绪美经营的人才派送公司有声有色，而她手下最得力干将早坂由纪夫（木村拓哉 饰）正是当年那个血泊中的青年，由纪夫自从那次事件后就失去了记忆，他被别有用心的奈绪美所收留，连这个名字都是对方给起的，由纪夫拥有极高的耐力和飞快的速度，他总能以媲美与奥运选手的效率送达包裹，在他身边，妖艳性感的秋山千明（筱原凉子 饰）甜言蜜语，她肩负着奈绪美的嘱托监视着由纪夫是否恢复了记忆。