为了制造出适合陪伴人类的海洋伙伴宠物，由海啸女士带领的靴子实验室抓走了比奇堡的所有居民，海绵宝宝和松鼠珊迪·奇克斯为了拯救比奇堡决心前往人类世界，开启了惊心动魄的冒险旅程。海绵宝宝和珊迪在得州被响尾蛇攻击，珊迪的家人们挺身而出帮二人脱险，并护送二人到了靴子实验室。在实验室里众人目睹了海啸女士的邪恶计划，海绵宝宝作为邪恶克隆计划的牺牲品被抓走命悬一线。在危急关头，珊迪发挥自己的聪明才智，在章鱼哥、派大星、蟹老板等比奇堡朋友们和奇克斯家人们的帮助下，排除万难成功阻止了海啸女士的克隆计划。

该片以儿童团员和革命后代挫败敌人偷袭西柏坡的行动为情节主线，讲述了发生在这一革命圣地的动人故事。儿童团团长核桃带着小妹妹枣花和小伙伴大金瓜，瞒着大人们偷偷上前线参军。途中意外遇见正在山里寻找西柏坡村的敌人奸细，得知了敌人打算里应外合轰炸西柏坡党中央指挥所的阴谋。核桃决定立刻返回村子报信。在核桃的带领下，孩子们穿过银河洞，翻越柏坡岭、神龙山，一路与追踪而来的敌人周旋。最终，核桃冒着生命危险，在掩护伙伴们逃脱的同时完成了报信任务，并和西柏坡儿童团一起迎来了新中国的诞生。