唯一的弟弟优（川村亮介 饰）和好友被几个不良少年欺负并杀害，收受贿赂的警方又判定为自杀，这一切使原本开朗快乐的高中生日高亚美（八代みなせ 饰）愤恨不已。然而不良少年的头头木村翔（西原信裕 饰）既拥有黑道背景，同时也是忍者服部半藏的后代。亚美复仇不成，反被切去手臂。　　危难时刻，幸得弟弟好友的父母——开办修理厂的杉原（石川ゆうや 饰）和美纪（亚纱美 饰）——的帮助得以生还，经过改造，断臂之处甚至可以装上威力无比的机关枪。亚美和杉原夫妇再次踏上复仇之路……

自风都塔建立30年以来，风都的和平持续了相当长一段时间。但是就在这个夏天，这座平静的城市再起波澜。一群本应死亡的Dopont突然出现在街头，对周遭进行大肆破坏。左翔太郎（桐山漣饰）和飞利浦（菅田将暉饰）合体变身为假面骑士W，风都警署警官照井龙（木ノ本嶺浩饰）则化身假面骑士阿克塞尔，与入侵的Dopont进行殊死搏斗。在国际特务调查机关员玛丽亚•S•克兰贝蒂（杉本彩饰）的协助下，正义战士们击退了入侵者，却发现他们原本都是佩戴了盖亚记忆体的普通市民。从玛丽亚的口中得知，国际重犯大道克己（松岡充饰）及其邪恶组织“Never”的成员们劫持了编号A~Z的26个盖亚记忆体，他们更阴谋占领风都。一场激烈的正邪战争即将展开……