纱名（大和田仁美配音）自幼生活在“研究所”中，从未涉足过外面的世界。她拥有能够任意改变周遭物体的超级能力，因此被当做“危险品”一般受到重重监护。某日，再也忍无可忍的纱名逃出了研究所，随即遭到了组织的追捕。无处可去的纱名在走投无路的境遇下遇见了名为㭴村藏六（大冢明夫配音）的老者，善良的老人收留了纱名。藏六和孙女早苗（丰崎爱生配音）过着相依为命的生活，如今家中多了一个女孩，生活倏地热闹起来。和纱名一起逃出来的，还有个性大大咧咧自由奔放的雏雾朝日（藤原夏海配音）和她的双胞胎妹妹雏雾夜长（鬼头明里配音），女孩们所要面对的，是步步紧逼的研究员以及她们扑朔迷离的身世。

木幡真琴（篠田南配音）是一名见习魔女，同时亦是一名十五岁的高中一年级女生。魔女界有一个约定俗成的规矩，那就是在十五岁成人礼之后，魔女们便要走上社会开始独自生活，进行魔女的修行。如此，真琴孤身一人来到了青森县，居住在堂兄仓本圭（菅原慎介配音）家中，转入了这里的高中，开始了崭新的生活。在这里，真琴结识了许多善良的朋友们，天真可爱对魔女稍稍有些害怕的仓木千夏（铃木绘里配音）、家中经营着酒铺的石渡直（三上枝织配音）、误食了魔法药而在白天会变成狗面的犬养（日野麻里配音）、和母亲与幽灵雏（金元寿子配音）一起经营咖啡店的椎名杏子（井口裕香配音）。在这些朋友们的陪伴下，有笑有泪的剧目拉开了序幕。

新的学期开始了，外表凶狠但内心纯良的少年高须龙儿（间岛淳司配音）决心利用重新分班的机会一扫往日同学对他的误解。更让他高兴的是，自己即将和暗恋了一年有余的栉枝实乃梨（堀江由衣配音）成为同班同学。除此之外，还有多年的死党北村祐作（野岛裕史配音）陪伴，一段崭新的高中生活展现在了龙儿的眼前。少女逢坂大河（钉宫理惠配音）的出现吸引了龙儿的目光，并不是因为此人傲娇腹黑的别扭个性，而是因为在偶然中，龙儿发现，大河居然暗恋着自己的好友祐作。在相互坦白了暗恋对象后，龙儿和大河决定结成统一的恋爱战线，利用相互的帮助来完成各自的恋爱蓝图。但现实并没有想象的那么简单，在重重的误会和波折之中，两人似乎对对方都产生了超越友谊的情感。

本作以星际旅行的科幻背景，讲述能够使用「以太齿轮」操纵重力的少年「四季」、没什么人气的实况主「蕾贝卡」，以及机械蓝猫「哈比」。他们将乘坐战列舰「EDNESZERO」四处冒险，寻找能够实现一切愿望的神秘生命体「MOTHER」。