阿肯（黎骏 饰）带着女友玲玲（徐玲玲 饰）以及一干好友前往一座地处偏远的荒岛，准备在那里开一场热闹而又淋漓尽致的派对。然而抵达小岛后，一行人才发现，原来他们并不是岛上唯一的一群游客。咸湿、吹水和山猪（黄秋生 饰）三名古惑仔也来到了小岛上，他们来这里是为了探访在这儿隐居的黑帮老大。

长江三峡，考古学家掘出庞然巨物，手工奇劣，一看竟是麦子仲肥又一废物出土！麦子，名兜，字仲肥，是我国一位吃饱撑的思想家、发明家。正当大家不知如何处置这大而无当之物，一位怀疑是麦子十八代后人的小朋友，麦兜（郭君彦/张正中配音），正与妈妈麦太（吴君如/宋丹丹配音）一起在香港发呆。麦兜很慢，很乖，很钝，被评定为多元低智能。麦太也好不了多少，半辈子乱冲乱扑，却都在扑空。为了自己，为了麦兜，麦太决定带麦兜来内地闯天下。到了武汉，麦太忍痛先把麦兜送到山上一武术学校“太乙春花门”寄宿。山上生活清苦，掌门道长（黄秋生/张立昆配音）呆头呆脑。麦兜无心习武，最大的乐趣是跟小同学偷入炼丹房煮方便面；值得庆幸的是，麦兜的身边还有一位可亲的助教“熊宝弟弟”，不时照顾麦兜。“世界幼儿园武术大赛”即将举行，“太乙春花门”小朋友软手软脚，看来只有挨揍的份儿。“国际幼儿园武术大赛”，麦兜迎战各地好打小朋友。这时，麦兜祖宗麦仲肥的巨物突然当、当、当的响起。原来这是个一年等于一秒，每三千六百年才报一次时的大钟…大成若缺，大器晚成。麦兜忽然领悟出太极拳，以至自己生命的道理……

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这是“古惑仔情义篇之洪兴十三妹”的延续篇。反映澳门极其阴暗的一面，既一片繁荣之后的人心茫茫，影片故事略显松散，吴君如再度饰演古惑仔经典人物“十三妹”，欠缺新意。因为父亲患上了帕金森症，使离开澳门十七年的十三妹重回旧地，临危受命接掌家族生意，其实所谓家族生意就是澳门繁荣的黄色事业。

狠心舅父陈有（黄秋生 饰）串同贼人绑架外甥小宝（小柏林 饰），小宝不幸遇害。其父母伤心过度，决定移民离开这个伤心地。临行前他们为屋子装上先进的防盗锁，而巨额赎金和小宝的鬼魂则留在屋中。陈有千方百计想要拿到赎金，却因防范严密而屡屡失手。情急之下，他重金聘请热心电子仪器的咪表收银员亚伟（梁朝伟 饰）和亚肥（郑则仕 饰）潜入屋中，偷盗藏有赎金的玩具猫，二人不知底细，欣然同意，却在屋中遭到小宝的戏弄，却也籍此知道了小宝遇害的始末……

大陆女子小倩（吴倩莲 饰）为了把弟弟从监狱中搭救出来，远赴香港准备卖身筹钱，不料却卷入黑社会大哥被杀一案，小倩从事发现场卷款逃走，黑社会内的真正凶手对小倩下达了追杀令。慌不择路的小倩将老警员彪叔（关海山 饰）打伤，逃到了赛车场，摩托车手阿富（郭富城 饰）助小倩脱离险境，又将其收留在家中。阿富本是富家公子，因酷爱赛车造成母亲车祸身亡，导致他和父亲（秦沛 饰）的关系疏远，独自在破败楼层中居住，每晚在赛场上挥洒孤独的青春。在警局遭受嘲笑的彪叔为了挽回同侪尊重，出力寻找小倩的下落，同时黑社会方面也渐渐逼近了阿富和小倩的所在。这天，在赛场上遭受搭档背叛的阿富回家时发现，他的家已经被黑社会付之一炬……

一个虔诚仁厚的牧师，住在港岛的宁静小镇，遗憾是太太离开了他移民美国，一天十六岁女儿突然离奇失踪，他四出寻找女儿，警察上门叫他去认尸，他为了保护一个据称认识其女儿的少女而卷入黑帮仇杀中。牧师带着她逃，去街上遇到了警员，怎料警察也是贪污的。他被埋在泥地下三日三夜，在半昏迷的情况下，奇迹般大雨降而牧师似从地狱走出来，横扫罪恶。

自幼青梅竹马的吴山水（周润发 饰）与郭飞莹（郑裕玲 饰）是一对甜蜜的恋人，但当飞莹自英国回到乡间后，她与山水之间的价值观截然不同了。加之山水的大男人主义，倔强的两人分手收场。分开后的山水认识了新女友阿珊（刘嘉玲 饰），飞莹也有了新男友，各自都有了不同的生活。直到新春，两人重逢都想起了开心的往昔，一起开车兜风，怎料车子直冲向了悬崖边……

一九八五年八月，澳门路环黑沙海滩发现人体残肢。警方重案组澳门司法部李Sir（李修贤饰）开始着手调查此案，发现八仙饭店郑氏一家在一夜间全部失踪，警方前往调查时，八仙饭店负责人王志恒（黄秋生饰）称郑氏一家已移民海外，并将饭店顶让给他。 随后李Sir查得郑氏一家并无出境纪录，伺机拘捕王协助调查，王企图潜返内地，将他拘捕落网。拘留期间，王非但不合作，并隐瞒事实，司法部惟有用尽各种办法，迫他召供，而王则在监牢内企图自杀与司法对抗。最后，用严刑迫供下，终于肯吐露杀人经过，但王最终割腕自杀也不愿面临最高二十四年的监禁。

Eva（蔡卓妍饰）与Adam（周柏豪饰）拍拖十年多，却因一件小事突然分手。莫名被分手的Adam酒后与学生Mandy（卫诗雅饰）发生了关系。可随后Mandy却在Adam家中意外发现了一本Eva所写的77次心碎记录，记事簿里Eva一次次的被伤害纪录历历在目⋯Adam愧疚不已，鼓起勇气在众目睽睽之前向Eva道歉。岂料，Eva却在Adam家中发现了Mandy的物品⋯到底她可否原谅Adam第78次呢？