15世纪的欧洲某国。在跳级中被允许进入大学的神童拉法尔。他回应了周围的期待，宣布将专攻当时最重要的神学。但是，从以前开始就热心投入的对天文的热情一直没有被抛弃。有一天，他遇到了一位名叫休伯特的神秘学者。因为触犯了基于异端思想的禁忌而受到拷问，被关进监狱的休伯特。他研究的是关于宇宙的冲击性的“某个假说”——。

FAIZ將劃破黑暗 為這個世界帶來光明。 發生在不遠的未來、某一個國家的故事…。 在那裡，世界的大半都已經被人類的進化型態── 「再生使徒」所支配。 再生使徒的城市裡，人類的存在是不被允釭滿C 躲躲藏藏過日子的人類當中， 有個少女名叫園田真理。 真理宣揚著FAIZ(乾巧)這位救世主的存在， 但是並沒有人願意相信她這個夢幻的故事。 智腦公司對１萬人的騎士部隊、 下達了殲滅人類命令。 「全員變身！」 獻給活在這個時代 卻失去了光明的所有人們的鉅作。

天城制药的派遣社员·佐藤唯（松井爱莉饰）因为爱犬死亡的悲伤，在酒吧里喝酒。与一个前来搭话的男子产生争执。没想到该名男子正是公司社长天城恭一（速水直道饰）。第二天，被社长叫去的唯，抱着被炒鱿鱼的觉悟来到了办公室。但是天城却对她说，“请把我当成奴隶”。

1994年8月25日发行的《超时空要塞PLUS》录像带版分4部，每集40分钟。它由摩砂雪监督，是《超时空要塞》系列中制作最精良的一部。它的取胜之道并不仅仅在于画面，在人物性格的刻画上也非常成功。作者通过对一些日常琐事的描写，将诸如理想与现实、友谊与爱情这样一些具有实际性的问题摆在观众的面前，发人深思，主题曲采用无伴奏的女声轻唱，更是烘托了深沉的气氛。这部作品也发售了英文版，同样取得了成功，片中歌曲全部改为英文版。这虽然是与作品制作精良有直接的关系，但也不能不说其情节的设计确实有过人之处。即使是挑剔的欧美观众也同样被其深深打动。

现代忍者的故事。

带着容易引起灾难的危险秘宝“魔剑目录”，居无定所的流浪剑士，殇不患。从祖国西幽离开辗转来到了东离之地后，好不容易获得了一时安宁的他，不料被仇敌“祸世螟蝗”得知这个消息，再次陷入危机之中。从遥远的西幽不断接揰而来的异能、异形的刺客们。就在殇不患面对这样的困境之中，身穿红莲之衣谜一般的吟游诗人就此现身。

在一次邂逅中得到死神的力量而成为“代理死神”的黑崎一护，

五角世界是一个由五颗行星围绕双太阳（太阳）组成的太阳系。在科姆星球的郊外，住着两个年轻人，达巴麦洛德和米拉乌曹，他们怀揣着远大的志向，离开家乡。五角世界虽然由统治者波塞冬统治，但政治腐败，各地叛军兴起，战乱不断。当达巴和他的朋友们遇到前强盗法内里亚·阿姆 (Fanneria Am) 和同样雄心勃勃的加布里特·加布雷 (Gabret Gabrai) 并发生冲突时，他们了解了五角大楼世界的真正本质。达巴驾驶着重金属L-Gaim与波塞冬军作战，最终成为叛军的领袖。

“维斯顿井”是位于海洋与陆地之间的一个异世界。那是一个深海与天空共存的世界，以地热和人的“灵气之力”为源头，甚至妖精费拉里奥与黑暗混沌共存。 A国的地方领主德雷克·拉夫特为了增强军事实力，试图吸引拥有强大气场的地表人类。其中一人，翔扎马，被授予灵气战士丹拜因，并被视为圣战士。然而，当他遇见叛逆者尼伊·吉文和他的追随者，地球女孩玛维尔·弗罗兹时，他面对了一些令人费解的话语。 “一个什么都不知道却帮助德雷克的愚蠢男人。”最终，“维斯顿之井”的冲突发展成为一团巨大的战争阴云，并席卷了地面世界。

西元1999年，一顆不明的巨大「流星」墜落在地球上。之後調查證實這其實是一艘外星人的宇宙船，之後世界的某些強國為了將其修復並彌補墜落時對地球環境所造成的破壞（還得掩蓋掉這個外星船墜落的事實），而組成了統合政府。並由地球統合軍將其改造成為全長1200公尺的超大型主力戰艦，命名為「馬克羅斯」（MACROSS，德文「大宇宙」之意）。其間人類卻也歷經統合派與反統合派國家陣營的分裂，在綿延的爭戰中馬克羅斯的改修則仍然持續著。直到10年後，在馬克羅斯舉行正式起用下水典禮的當天，在月球軌道附近突然發現有大規模的時空跳躍反應。而此時馬客羅斯艦上的主炮竟自動發射，並擊中在月球出現的外星艦隊觀測艦！事已至如此頓時成了趕鴨子上架，不把對方惹毛才是怪事……於是統合軍只好展開接戰，並讓馬克羅斯升空啟航，以轉移敵方注意。青年一條輝陰錯陽差的坐上了統合軍的戰機捲入戰鬥，並救起了一位名叫林明美的少女，且與艦上女軍官早賴未沙的不吵不相識……被稱為「第一次宇宙大戰」的這場人類對異星人的戰爭就此揭開了序幕。而圍繞在輝、明美與未沙之間的感情糾葛，卻也開始介入了戰事的發展之中，甚而成為主導後來歷史走向的契機……